在丰臣统治时期二本松城曾经成为蒲生氏乡、上杉景胜、蒲生秀行及蒲生忠乡管治下的一座支城。1627年蒲生忠乡病逝，在无子继承下，由加藤嘉明入藩管治。嘉明的外婿松下重纲封被到二本松城，重纲同年身亡由长子长纲。一年后，加藤明利入主，直至1643年被改易为止。

1643年10月1日，丹羽长重入藩，直到废藩置县为止，仍由丹羽氏管治。

松下家

外样3万石

松下重纲（1627年）

松下长纲（1627年－1628年）

加藤家

外样3万石

加藤明利（1628年－1643年）

丹羽家

外样、10万700石→5万700石

丹羽光重（1643年－1679年）

丹羽长次（1679年－1698年）

丹羽长之（1698年－1700年）

丹羽秀延（1701年－1728年）

丹羽高寛（1728年－1745年）

丹羽高庸（1745年－1765年）

丹羽长贵（1765年－1796年）

丹羽长祥（1796年－1813年）

丹羽长富（1813年－1858年）

丹羽长国（1858年－1868年）

丹羽长裕（1868年－1871年）