"发酵工程"是个多义词，它可以指发酵工程（学科）,发酵工程（2012年高等教育出版社出版书籍）。

• 发酵工程（学科） 发酵工程，是指采用现代工程技术手段，利用微生物的某些特定功能，为人类生产有用的产品，或直接把微生物应用于工业生产过程的一种新技术。发酵工程的内容包括菌种的选育、培养基的配制、灭菌、扩大培养和接种、发酵过程和产品的分离提纯等方面。
  
• 发酵工程（2012年高等教育出版社出版书籍） 《发酵工程》是徐岩主编，高等教育出版社2012年出版的普通高等教育“十一五”国家级规划教材。该书适合作为发酵工程、生物工程、生化工程等专业的本科教材，也可作为相关专业的研究生、教师及科研人员的参考书。
  全书分为4篇共20章，包括发酵工程原理、重要发酵工程产业、发酵工程的特殊应用和发酵工程的生物学基础等篇章，介绍了现代发酵工程各产业用原料的选择、处理和培养基的制备；发酵工业微生物的扩大培养和染菌的控制；发酵过程的变化规律及其控制和优化等。