第六世代，只发生在对战过程中的暂时性进化。然而并非所有的神奇宝贝都能百万进化，这种进化目前仅出现在特定的神奇宝贝身上。

• 进化效果
  百万进化后的超梦和路卡利欧
  火焰鸡经百万进化变为百万火焰鸡
• 百万进化
  （日文︰ メガシンカ，英文︰ Mega Evolution）是一种首次出现在第六世代，只发生在对战过程中的暂时性进化。然而并非所有的神奇宝贝都能百万进化，这种进化仅出现在特定的神奇宝贝身上。
  要进行百万进化，必须在对战之前，由该神奇宝贝携带相对应的百万石，也要有一定的亲密度。战斗时，主角以食指和中指触碰另一手手腕上百万环中的键石，和神奇宝贝身上所携带的百万石产生共鸣，使神奇宝贝在该回合对战双方出招之前发生百万进化。但并非所有人的键石都放置于百万环上，例如道馆训练家小黄瓜的键石位于手套上、闪光队首领强蜀的键石位于戒指上、冠军康乃则放置于项链上。
  条件方面，在每场对战中，主角的队伍只能有一只神奇宝贝发生百万进化，但队伍里可以存在多只携带百万石的神奇宝贝，在对战未结束之前，百万神奇宝贝无法变回原来的样子，就算交换也一样，且即使该百万神奇宝贝濒死，其他神奇宝贝也无法进行百万进化，复活后也只能恢复一般状态，无法再次进行百万进化。对战结束后，百万进化的神奇宝贝将会恢复原样。
  通过百万石进化后的神奇宝贝，在种族值、属性、特性都可能会有所改变。
• 游戏中
  在满足所有百万进化的条件之后，下屏底部会出现百万进化的图标且闪光，选择百万进化后，再选择上方的技能，便可百万进化和攻击。百万进化不占用回合数，如果选择百万进化的图标后而不选择技能，返回菜单，那么百万进化的选项将会自动取消，需要再次点击。
  神奇宝贝的攻击顺序是根据百万进化时所使出的技能的速度来判定的，和百万进化后的速度并无关联。百万进化后，拥有百万进化特性的神奇宝贝会自动转换特性。百万进化可以无视一些强制性无法行动的状态，例如冰冻和睡眠等，但对于因技能而直接跳过行动回合的状态是无法百万进化的。
  当神奇宝贝携带与其对应的百万石时，对方无论使出什么技能都无法将其交换或拿走，但如果携带的百万石并不与神奇宝贝对应，则和其它道具相同。当神奇宝贝变身为其它神奇宝贝时，也无法触发百万进化。
• 动画中

  神奇宝贝 THE ORIGIN

  在神奇宝贝 THE ORIGIN中，富士老人赠送给Red能让喷火龙进化的 喷火龙石X和键石，Red在大木博士那里得知它的用法后，在华蓝洞和超梦决战时，让自己的喷火龙百万进化。据大木博士所说，富士老人曾经研究过百万进化。

  神奇宝贝XY

  在 来到卡洛斯地方了！梦想与冒险的开始!!中，小智在机场看见了一只神秘的神奇宝贝，那就是百万进化后的火焰鸡。在下一集中，百万火焰鸡救下了从光棱塔掉下来的小智和皮卡丘。 在 百万进化与光棱塔！中，法桐博士提到他和助手们正在研究百万进化，听到百万进化可以增强神奇宝贝能力的火箭队三人组也扮成百万进化专家来拜访法桐博士，想要乘机夺走百万进化的资料。
• mega精灵

  全国编号	名称	属性	特性	种族值
  003	妙蛙花	草+毒	厚脂肪	625
  006	喷火龙X	火+龙	坚硬之爪	634
  006	喷火龙Y	火+飞	干旱	634
  009	水箭龟	水	超强炮台	630
  065	胡地	超	复制	590
  094	耿鬼	鬼+毒	踩影	600
  115	袋龙	普	亲子爱	590
  127	大甲	虫+飞	天空皮肤	600
  130	暴鲤龙	水+恶	破格	640
  142	化石翼龙	岩+飞	坚硬之爪	615
  150	超梦X	超+斗	不屈之心	780
  	超梦Y	超	不眠	780
  181	电龙	电+龙	破格	610
  212	巨钳螳螂	虫+钢	技师	600
  214	赫拉克罗斯	虫+斗	技能连锁	600
  229	黑鲁加	恶+火	太阳之力	600
  248	班吉拉	岩+恶	起沙	700
  254	蜥蜴王	草+龙	避雷针	630
  257	火焰鸡	火+斗	加速	630
  260	巨沼怪	水+地	轻快	635
  282	沙奈朵	超+妖	妖精皮肤	618
  302	勾魂眼	恶+幽	魔法反射	480
  303	大嘴娃	钢+妖	大力士	480
  306	波士可多拉	钢	过滤器	630
  308	恰雷姆	斗+超	瑜伽之力	510
  310	雷电兽	电	威吓	575
  334	七夕青鸟	龙+妖精	妖精皮肤
  354	诅咒娃娃	鬼	恶作剧之心	555
  359	阿勃梭鲁	恶	魔法反射	565
  373	暴蝾螈	龙+飞行	天空皮肤
  376	巨金怪	刚+超能	坚硬爪子
  380	拉迪亚斯	龙+超	浮游	700
  381	拉帝欧斯	龙+超	浮游	700
  428	长耳兔	一般+格斗	胆量
  445	烈咬陆鲨	龙+地	沙之力量	700
  448	路卡利欧	斗+钢	适应力	625
  460	暴雪王	草+冰	降雪	594
  719	蒂安希	岩+妖	魔法反射	700
• 细节
  所有可以百万进化的神奇宝贝百万进化之后，其新名字都是在原名之前加上メガ，然而有两只神奇宝贝（大菊花和梅卡阳玛）的原名就带有メガ（分别是メガニウム和メガヤンマ），因此一时成为调侃的对象。
  第五世代、第六世代新增加的神奇宝贝中没有任何一只可以百万进化。
  在游戏中，只有在本次开启游戏后主角第一次进行百万进化时才会出现完整版的动画，其它时候都是简要版的动画。
  百万进化之后，HP的种族值不会发生改变，其他五项种族值不论增减，相加起来都比进化前多100，胡地是唯一的例外，因为在第六世代特防相比第五世代增加10的关系，使得百万进化之后种族值合计只增加90。
  但是在第六世代同样增加了种族值的电龙没有出现此现象。
  百万进化之后，只有防御和速度的种族值可能下降，其中电龙（55→45）、赫拉克斯（85→75）、烈咬陆鲨（102→92）、暴雪王（60→30）的速度下降；超梦Y（90→70）则是唯一出现防御下降情况的百万进化神奇宝贝。
  拥有性别差异的神奇宝贝（妙蛙花、胡地、暴鲤龙、巨钳螳螂、赫拉克罗斯、黑鲁加、火焰鸡、恰雷姆、烈咬陆鲨、暴雪王）在百万进化之后，性别差异会消失。
  在可以透过特性开启的四种天气之中，只有下雨无法透过百万进化启动，因为没有任何一只百万进化后的神奇宝贝的特性为毛毛雨。
  能够百万进化的神奇宝贝囊括了全部18种属性。