IgE抗体的尾部与嗜碱细胞、肥大细胞的细胞膜结合。当抗体与抗原结合后，嗜碱细胞与肥大细胞释放组织胺一类的物质促进炎症的发展。这也是引发速发型过敏反应的抗体。

IgE抗体是正常人血清中含量最少的Ig，血清浓度极低，约为5x10^-5 mg/ml。主要由粘膜下淋巴组织中的浆细胞分泌。IgE分子量为160kD，IgE抗体的重要特征为亲细胞抗体，其CH2和CH3结构域可与肥大细胞，嗜碱性粒细胞上的高亲和力FcεR I 结合，当结合再次进入机体的抗原后可引起I型超敏反应。此外，IgE抗体可能与机体抗寄生虫免疫有关。