"代谢工程"是个多义词，它可以指代谢工程（学科领域）,代谢工程（2015年高等教育出版社出版书籍）。

• 代谢工程（学科领域） 代谢工程（Metabolic engineering）是指利用多基因重组技术有目的的对细胞代谢途径进行修饰、改造，改变细胞特性，并与细胞基因调控、代谢调控及生化工程相结合，为实现构建新的代谢途径生产特定目的产物而发展起来的一个新的学科领域。可以说是基因工程的高级阶段。
  
• 代谢工程（2015年高等教育出版社出版书籍） 《代谢工程》是赵学明、陈涛、王智文等编著，高等教育出版社2015年出版的普通高等教育“十一五”国家级规划教材。该书可作为生物工程、生物技术等相关专业研究生、高年级本科生的教学用书，也可供在生物工程、化学工程等相关领域的研究、开发及工程设计人员参考。
  全书共分12章，主要包括代谢工程的基本原理与方法以及“基于¹³C同位素信息的代谢通量分析”“基因组尺度代谢网络模型”等技术在代谢工程中的应用等内容，并列举了代谢工程的典型实例。