氨酰-TRNA合成酶使氨基酸结合到特定的TRNA上：

每一个氨酰-TRNA合成酶可识别一个特定的氨基酸和与此氨基酸对应的TRNA的特定部位 

氨酰-TRNA合成酶的辨认位点：

大肠杆菌TRNAALA氨基酸臂是酶的辨认位点。

大肠杆菌的氨酰-TRNAGLN合成酶的晶体结构（a）和

大肠杆菌的氨酰-TRNAGLN合成酶的图解，紫色球代表磷原子（b）