《被子植物APG分类法》是1998年由被子植物种系发生学组（APG）出版的一种对于被子植物的现代分类法。这种分类法和传统的依照形态分类不同，是主要依照植物的三个基因组DNA的顺序，以亲缘分支的方法分类，包括两个叶绿体和一个核糖体的基因编码。虽然主要依据分子生物学的数据，但是也参照其他方面的理论，例如将真双子叶植物分支和其他原来分到双子叶植物纲中的种类区分，也是根据花粉形态学的理论。
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基本分支
如下：被子植物 angiosperms :单子叶植物分支 monocots鸭跖草分支 commelinids真双子叶植物分支 eudicots核心真双子叶植物分支 core eudicots蔷薇分支 rosidsI类真蔷薇分支 eurosids III类真蔷薇分支 eurosids II菊分支 asteridsI类真菊分支 euasterids III类真菊分支 euasterids II
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具体分类
APG系统下设分类包括40个目和462个科，下列表中开始部分是没有分到任何一个分支内的科或目。有的科分布地域非常狭小或新分出的科，尚未有通用的汉语译名。被子植物分支 angiosperms无油樟科 Amborellaceae木兰藤科 Austrobaileyaceae白桂皮科 Canellaceae金粟兰科 Chloranthaceae菌花科 Hydnoraceae八角茴香科 Illiciaceae睡莲科 Nymphaeaceae + 莼菜科 Cabombaceae大花草科 Rafflesiaceae五味子科 Schisandraceae腺齿木科 Trimeniaceae林仙科 Winteraceae金鱼藻目 Ceratophyllales金鱼藻科 Ceratophyllaceae樟目 Laurales香皮茶科 Atherospermataceae腊梅科 Calycanthaceae腺蕊花科 Gomortegaceae莲叶桐科 Hernandiaceae樟科 Lauraceae杯轴花科 Monimiaceae坛罐花科 Siparunaceae木兰目 Magnoliales番荔枝科 Annonaceae单室木兰科 Degeneriaceae帽花木科 Eupomatiaceae舌蕊花科 Himantandraceae木兰科 Magnoliaceae肉豆蔻科 Myristicaceae胡椒目 Piperales马兜铃科 Aristolochiaceae短蕊花科 Lactoridaceae胡椒科 Piperaceae三白草科 Saururaceae单子叶植物分支 monocots白玉簪科 Corsiaceae樱井草科 Japonoliriaceae纳茜菜科 Nartheciaceae无叶莲科 Petrosaviaceae霉草科 Triuridaceae菖蒲目 Acorales菖蒲科 Acoraceae泽泻目 Alismatales泽泻科 Alismataceae水蕹科 Aponogetonaceae天南星科 Araceae花蔺科 Butomaceae丝粉藻科 Cymodoceaceae水鳖科 Hydrocharitaceae水麦冬科 Juncaginaceae黄花绒叶草科 Limnocharitaceae波喜荡草科 Posidoniaceae眼子菜科 Potamogetonaceae川蔓藻科 Ruppiaceae芝菜科 Scheuchzeriaceae岩菖蒲科 Tofieldiaceae大叶藻科 Zosteraceae天门冬目 Asparagales百子莲科 Agapanthaceae龙舌兰科 Agavaceae葱科 Alliaceae石蒜科 Amaryllidaceae知母科 Anemarrhenaceae吊兰科 Anthericaceae星捧月科 Aphyllanthaceae天门冬科 Asparagaceae独尾草科 Asphodelaceae芳香草科 Asteliaceae非洲菝葜科 Behniaceae香水花科 Blandfordiaceae澳韭兰科 Boryaceae铃兰科 Convallariaceae矛花科 Doryanthaceae萱草科 Hemerocallidaceae异菝葜科 Herreriaceae风信子科 Hyacinthaceae仙茅科 Hypoxidaceae鸢尾科 Iridaceae鸢尾蒜科 Ixioliriaceae毛石蒜科 Lanariaceae异蕊草科 Laxmanniaceae兰科 Orchidaceae蓝星科 Tecophilaeaceae紫灯花科 Themidaceae刺叶树科 Xanthorrhoeaceae血剑草科 Xeronemataceae薯蓣目 Dioscoreales水玉簪科 Burmanniaceae薯蓣科 Dioscoreaceae蒟蒻薯科 Taccaceae肉质腐生科 Thismiaceae毛柄花科 Trichopodaceae百合目 Liliales六出花科 Alstroemeriaceae金梅草科 Campynemataceae秋水仙科 Colchicaceae百合科 Liliaceae菝葜木科 Luzuriagaceae黑药花科 Melanthiaceae垂花科 Philesiaceae菝葜藤科 Rhipogonaceae菝葜科 Smilacaceae露兜树目 Pandanales环花草科 Cyclanthaceae露兜树科 Pandanaceae百部科 Stemonaceae翡若翠科 Velloziaceae鸭跖草分支 commelinoids阿波波达草科 Abolbodaceae凤梨科 Bromeliaceae多须草科 Dasypogonaceae匍茎草科 Hanguanaceae苔草科 Mayacaceae偏穗草科 Rapateaceae槟榔目 Arecales槟榔科 Arecaceae鸭跖草目 Commelinales鸭跖草科 Commelinaceae血皮草科 Haemodoraceae田葱科 Philydraceae雨久花科 Pontederiaceae禾本目 Poales苞穗草科 Anarthriaceae刺鳞草科 Centrolepidaceae莎草科 Cyperaceae二柱草科 Ecdeiocoleaceae谷精草科 Eriocaulaceae须叶藤科 Flagellariaceae独蕊草科 Hydatellaceae拟苇科 Joinvilleaceae灯心草科 Juncaceae禾本科 Poaceae袖珍棕榈科 Prioniaceae帚灯草科 Restionaceae黑三棱科 Sparganiaceae梭子草科 Thurniaceae香蒲科 Typhaceae黄眼草科 Xyridaceae姜目 Zingiberales美人蕉科 Cannaceae闭鞘姜科 Costaceae蝎尾蕉科 Heliconiaceae兰花蕉科 Lowiaceae竹芋科 Marantaceae芭蕉科 Musaceae鹤望兰科 Strelitziaceae姜科 Zingiberaceae真双子叶植物分支 eudicots黄杨科 Buxaceae双颊果科 Didymelaceae清风藤科 Sabiaceae昆栏树科 Trochodendraceae + 水青树科 Tetracentraceae山龙眼目 Proteales莲科 Nelumbonaceae悬铃木科 Platanaceae山龙眼科 Proteaceae毛茛目 Ranunculales小檗科 Berberidaceae星叶草科 Circaeasteraceae + 独叶草科 Kingdoniaceae领春木科 Eupteleaceae木通科 Lardizabalaceae防己科 Menispermaceae罂粟科 Papaveraceae + 荷包牡丹科 Fumariaceae+ 蕨叶草科 Pteridophyllaceae毛茛科 Ranunculaceae核心真双子叶植物分支 core eudicots鳞枝树科 Aextoxicaceae智利藤科 Berberidopsidaceae五桠果科 Dilleniaceae洋二仙草科 Gunneraceae香灌木科 Myrothamnaceae葡萄科 Vitaceae石竹目 Caryophyllales玛瑙果科 Achatocarpaceae番杏科 Aizoaceae苋科 Amaranthaceae钩枝藤科 Ancistrocladaceae翼萼茶科 Asteropeiaceae落葵科 Basellaceae仙人掌科 Cactaceae石竹科 Caryophyllaceae龙树科 Didiereaceae双钩叶科 Dioncophyllaceae茅膏菜科 Droseraceae露叶毛毡苔科 Drosophyllaceae瓣鳞花科 Frankeniaceae粟米草科 Molluginaceae猪笼草科 Nepenthaceae紫茉莉科 Nyctaginaceae非洲桐科 Physenaceae商陆科 Phytolaccaceae蓝雪科 Plumbaginaceae蓼科 Polygonaceae马齿苋科 Portulacaceae棒木科 Rhabdodendraceae肉叶刺茎藜科 Sarcobataceae油蜡树科 Simmondsiaceae闭籽花科 Stegnospermataceae柽柳科 Tamaricaceae檀香目 Santalales铁青树科 Olacaceae山柚子科 Opiliaceae桑寄生科 Loranthaceae羽毛果科 Misodendraceae檀香科 Santalaceae虎耳草目 Saxifragales枫香科 Altingiaceae连香树科 Cercidiphyllaceae景天科 Crassulaceae交让木科 Daphniphyllaceae茶藨子科 Grossulariaceae小二仙草科 Haloragaceae金缕梅科 Hamamelidaceae鼠刺科 Iteaceae芍药科 Paeoniaceae扯根菜科 Penthoraceae齿蕊科 Pterostemonaceae虎耳草科 Saxifragaceae四果木科 Tetracarpaeaceae蔷薇分支 rosids单果树科 Aphloiaceae燧体木科 Crossosomataceae西兰木科 Ixerbaceae刺球果科 Krameriaceae美洲苦木科 Picramniaceae川苔草科 Podostemaceae旌节花科 Stachyuraceae省沽油科 Staphyleaceae三裂科 Tristichaceae蒺藜科 Zygophyllaceae牻牛儿苗目 Geraniales花茎草科 Francoaceae牻牛儿苗科 Geraniaceae + 高柱花科 Hypseocharitaceae鞘叶树科 Greyiaceae杜香果科 Ledocarpaceae蜜花科 Melianthaceae曲胚科 VivianiaceaeI类真蔷薇分支 eurosids I卫矛科 Celastraceae蒜树科 Huaceae梅花草科 Parnassiaceae + 微形草科 Lepuropetalaceae木根草科 Stackhousiaceae葫芦目 Cucurbitales四柱木科 Anisophylleaceae秋海棠科 Begoniaceae马桑科 Coriariaceae棒果木科 Corynocarpaceae葫芦科 Cucurbitaceae野麻科 Datiscaceae四数木科 Tetramelaceae豆目 Fabales豆科 Fabaceae远志科 Polygalaceae皂皮树科 Quillajaceae海人树科 Surianaceae壳斗目 Fagales桦木科 Betulaceae木麻黄科 Casuarinaceae山毛榉科 Fagaceae胡桃科 Juglandaceae杨梅科 Myricaceae南青冈科 Nothofagaceae马尾树科 Rhoipteleaceae太果木科 Ticodendraceae金虎尾目 Malpighiales钟花科 Achariaceae槲树果科 Balanopaceae油桃木科 Caryocaraceae金壳果科 Chrysobalanaceae藤黄科 Clusiaceae毒鼠子科 Dichapetalaceae古柯科 Erythroxylaceae大戟科 Euphorbiaceae合丝花科 Euphroniaceae大风子科 Flacourtiaceae毛药树科 Goupiaceae亚麻藤科 Hugoniaceae香膏科 Humiriaceae金丝桃科 Hypericaceae包芽树科 Irvingiaceae粘木科 Ixonanthaceae裂药花科 Lacistemataceae亚麻科 Linaceae王冠草科 Malesherbiaceae金虎尾科 Malpighiaceae水母柱科 Medusagynaceae金莲木科 Ochnaceae小盘木科 Pandaceae西番莲科 Passifloraceae非洲核果木科 Putranjivaceae羽叶树科 Quiinaceae红树科 Rhizophoraceae杨柳科 Salicaceae杯盖花科 Scyphostegiaceae三角果科 Trigoniaceae时钟花科 Turneraceae堇菜科 Violaceae酢浆草目 Oxalidales土瓶草科 Cephalotaceae牛栓藤科 Connaraceae火把树科 Cunoniaceae杜英科 Elaeocarpaceae酢浆草科 Oxalidaceae孔药花科 Tremandraceae蔷薇目 Rosales钩毛树科 Barbeyaceae大麻科 Cannabaceae伞树科 Cecropiaceae朴科 Celtidaceae八瓣果科 Dirachmaceae胡颓子科 Elaeagnaceae桑科 Moraceae鼠李科 Rhamnaceae蔷薇科 Rosaceae榆科 Ulmaceae荨麻科 UrticaceaeII类真蔷薇分支 eurosids II瘿椒树科 Tapisciaceae十字花目 Brassicales叠珠树科 Akaniaceae + 钟萼木科 Bretschneideraceae藜木科 Bataceae十字花科 Brassicaceae番木瓜科 Caricaceae澳远志科 Emblingiaceae环蕊科 Gyrostemonaceae刺枝树科 Koeberliniaceae池花科 Limnanthaceae辣木科 Moringaceae瘤药树科 Pentadiplandraceae木犀草科 Resedaceae刺茉莉科 Salvadoraceae夷白花菜科 Setchellanthaceae烈味三叶草科 Tovariaceae旱金莲科 Tropaeolaceae锦葵目 Malvales红木科 Bixaceae + 弯子木科 Cochlospermaceae半日花科 Cistaceae地果莲木科 Diegodendraceae龙脑香科 Dipterocarpaceae锦葵科 Malvaceae文定果科 Muntingiaceae沙莓科 Neuradaceae旋花树科 Sarcolaenaceae球萼树科 Sphaerosepalaceae瑞香科 Thymelaeaceae桃金娘目 Myrtales双翼果科 Alzateaceae使君子科 Combretaceae隐翼科 Crypteroniaceae异裂果科 Heteropyxidaceae千屈菜科 Lythraceae野牡丹科 Melastomataceae谷木科 Memecylaceae桃金娘科 Myrtaceae方枝树科 Oliniaceae柳叶菜科 Onagraceae管萼科 Penaeaceae裸木科 Psiloxylaceae喙萼花科 Rhynchocalycaceae蜡烛树科 Vochysiaceae无患子目 Sapindales漆树科 Anacardiaceae薰倒牛科 Biebersteiniaceae橄榄科 Burseraceae番苦木科 Kirkiaceae楝科 Meliaceae白刺科 Nitrariaceae + 骆驼蓬科 Peganaceae芸香科 Rutaceae无患子科 Sapindaceae苦木科 Simaroubaceae菊分支 asterids山茱萸目 Cornales山茱萸科 Cornaceae + 珙桐科 Nyssaceae假石南科 Grubbiaceae绣球花科 Hydrangeaceae水穗草科 Hydrostachyaceae刺莲花科 Loasaceae杜鹃花目 Ericales猕猴桃科 Actinidiaceae凤仙花科 Balsaminaceae山柳科 Clethraceae翅萼树科 Cyrillaceae岩梅科 Diapensiaceae柿树科 Ebenaceae杜鹃花科 Ericaceae福桂花科 Fouquieriaceae银钟花科 Halesiaceae玉蕊科 Lecythidaceae蜜囊花科 Marcgraviaceae紫金牛科 Myrsinaceae假红树科 Pellicieraceae花荵科 Polemoniaceae报春花科 Primulaceae捕蝇幌科 Roridulaceae山榄科 Sapotaceae瓶子草科 Sarraceniaceae野茉莉科 Styracaceae山矾科 Symplocaceae厚皮香科 Ternstroemiaceae四籽树科 Tetrameristaceae山茶科 Theaceae假轮叶科 TheophrastaceaeI类真菊分支 euasterids I紫草科 Boraginaceae环生籽科 Plocospermataceae二歧草科 Vahliaceae绞木目 Garryales桃叶珊瑚科 Aucubaceae杜仲科 Eucommiaceae绞木科 Garryaceae五蕊茶科 Oncothecaceae龙胆目 Gentianales夹竹桃科 Apocynaceae胡蔓藤科 Gelsemiaceae龙胆科 Gentianaceae马钱科 Loganiaceae茜草科 Rubiaceae唇形目 Lamiales爵床科 Acanthaceae海榄雌科 Avicenniaceae紫葳科 Bignoniaceae醉鱼草科 Buddlejaceae腺毛草科 Byblidaceae盘果木科 Cyclocheilaceae苦苣苔科 Gesneriaceae唇形科 Lamiaceae狸藻科 Lentibulariaceae苦槛蓝科 Myoporaceae木犀科 Oleaceae泡桐科 Paulowniaceae胡麻科 Pedaliaceae + 角胡麻科 Martyniaceae透骨草科 Phrymaceae车前科 Plantaginaceae夷地黄科 Schlegeliaceae玄参科 Scrophulariaceae密穗草科 Stilbaceae四粉草科 Tetrachondraceae马鞭草科 Verbenaceae茄目 Solanales旋花科 Convolvulaceae田基麻科 Hydroleaceae山醋李科 Montiniaceae茄科 Solanaceae楔瓣花科 SphenocleaceaeII类真菊分支 euasterids II五福花科 Adoxaceae鳞叶树科 Bruniaceae香茜科 Carlemanniaceae弯药树科 Columelliaceae + 离水花科 Desfontainiaceae寄奴花科 Eremosynaceae南鼠刺科 Escalloniaceae茶茱萸科 Icacinaceae多香木科 Polyosmaceae楔蕊花科 Sphenostemonaceae智利木科 Tribelaceae伞形目 Apiales伞形科 Apiaceae五加科 Araliaceae假茱萸科 Aralidiaceae夷茱萸科 Griseliniaceae番茱萸科 Melanophyllaceae海桐花科 Pittosporaceae鞘柄木科 Torricelliaceae冬青目 Aquifoliales冬青科 Aquifoliaceae青荚叶科 Helwingiaceae叶茶藨科 Phyllonomaceae菊目 Asterales假海桐科 Alseuosmiaceae雪叶科 Argophyllaceae菊科 Asteraceae头花草科 Calyceraceae桔梗科 Campanulaceae + 半边莲科 Lobeliaceae腕带花科 Carpodetaceae陀螺果科 Donatiaceae草海桐科 Goodeniaceae睡菜科 Menyanthaceae五膜草科 Pentaphragmataceae石冬青科 Phellinaceae卢梭木科 Rousseaceae花柱草科 Stylidiaceae川续断目 Dipsacales忍冬科 Caprifoliaceae黄锦带科 Diervillaceae川续断科 Dipsacaceae北极花科 Linnaeaceae刺续断科 Morinaceae败酱科 Valerianaceae
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系属不清的科
蛇菰科 Balanophoraceae多子科 Bonnetiaceae心翼果科 Cardiopteridaceae垂籽树科 Ctenolophonaceae锁阳科 Cynomoriaceae簇花草科 Cytinaceae十齿花科 Dipentodontaceae沟繁缕科 Elatinaceae四棱果科 Geissolomataceae单柱花科 Hoplestigmataceae扁果树科 Kaliphoraceae洋酢浆草科 Lepidobotryaceae光果科 Lissocarpaceae五翼果科 Lophopyxidaceae毛丝花科 Medusandraceae管花木科 Mettenusiaceae帽蕊草科 Mitrastemonaceae盔瓣花科 Paracryphiaceae五列木科 Pentaphylacaceae围盘树科 Peridiscaceae斜翼科 Plagiopteraceae单室木科 Pottingeriaceae肋果茶科 Sladeniaceae栓皮果科 Strasburgeriaceae苦皮树科 Tepuianthaceae
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参见
植物学被子植物